Читать книгу Профилактика коронавирусной инфекции - Александр Герасимович - Страница 4

Структура и свойства

Новый вирус SARS-CoV-2 – это несегментированный РНК-содержащий (single-stranded, ssRNA) бетакоронавирус (относится к тому же семейству, что и MERS-CoV и SARS-CoV). Принадлежит к семейству Coronaviridae, подсемейству Orthocoronavirinae, род Betacoronavirus, подрод Sarbecoviridae. Размер вируса – 0,1 микрон.

На вирусной поверхности находятся гликопротеиновые «шипы» – спайки (S, spike), состоящие из двух субъединиц (S1 и S2). [6.1.] S-гликопротеин SARS-CoV-2 связывается с рецепторами клеток-хозяев ангиотензин-превращающим ферментом 2 (ACE2), что является решающим для проникновения вируса. [7]

SARS-CoV-2 считался генетически более стабильным, чем SARS-CoV и MERS-CoV. Однако в публикации от 12 марта сказано, что в геноме коронавируса SARS-CoV-2, который обнаружен у восьми госпитализированных пациентов в Сингапуре, зафиксирована делеция (потеря части генетического материала). [8]

Популяционный генетический анализ 103 геномов SARS-CoV-2 показал, что вирус эволюционировал в два основных типа (L и S). Тип L (∼70%) более распространен, чем тип S (∼30%). Тип S эволюционно старше и менее агрессивен. [9]

Стабильность при разных условиях окружающей среды

Температура: 4° С – выживаемость более 14 дней, 22° С – выживаемость от 7 до 14 дней, 70° С – выживаемость до 5 минут.

Выживание на поверхностях: бумага – до 3 часов, одежда и дерево – до 2 дней, сталь и пластик – до 7 дней, стекло – до 4 дней, банкноты – до 4 дней, внешняя поверхность маски – больше 7 дней. Вирус чувствителен к бытовому отбеливателю, этанолу (70%), хлоргексидину (0,05%) и т. д. [10]

Происхождение

В определенный момент вирус мутировал и приобрел новый протеин, который сделал его опасным для человека. Это произошло в процессе спилловера (англ. spillover).

Резервуар – летучие мыши (Rhinolophus sinicus [12]); промежуточный хозяин: ящерица панголин (Manis javanica)? Существование промежуточного животного-хозяина SARS-CoV-2 между вероятным резервуаром летучей мыши и людьми все еще находится в стадии исследования. [13]

На основании имеющейся информации, неизвестно, оказывает ли 2019-nCoV какое-либо влияние на здоровье животных, и о каких-либо конкретных событиях не сообщалось ни у одного вида. [14]

22 января в Journal of Medical Virology Wei Ji и соавторами было опубликовано исследование о том, что 2019-nCoV обладает наиболее сходной генетической информацией с коронавирусом летучей мыши и наиболее схожим смещением в использовании кодонов со змеей. Тем не менее, последующие исследования показали, что источником вируса всё же являются летучие мыши.

Обнаружение белка AS-SCoV2 и bat-SL-RatG13 у вируса SARS-CoV-2 позволило предположить, что новый коронавирус, вероятно, возник в результате генетического дрейфа из bat-SL-CoV-RaTG13. [15]

В исследование «Genomic variance of the 2019‐nCoV coronavirus» обнаружено, что геном CoV летучей мыши на 96,2% идентичен геному 2019-nCoV. [16]

Учёные пришли к выводу, что вирус SARS-CoV-2 не произошел непосредственно от панголинов. Однако, из-за ограниченных метагеномных данных о вирусах, полученных из панголинов, нельзя исключить, что другие китайские панголины могут содержать коронавирусы, которые демонстрируют большее сходство с вирусом SARS-CoV-2. [17]

Анализ общедоступных данных о последовательности генома из SARS-CoV-2 и родственных вирусов выявил доказательства того, что вирус не был произведен в лаборатории. [18]

До сих пор нет доказательств того, что морепродукты с рынка в Ухане вызвали пневмонию, связанную с 2019-nCoV. [19]

Механизмы передачи

1) Прямой – воздушно-капельный (через капельки слюны). Новый коронавирус – это респираторный вирус, который распространяется в основном при контакте с капельками, образующимися при дыхании инфицированных людей, например, когда они чихают, кашляют или сморкаются.

2) непрямой (контактно-бытовой) – при прикосновении к поверхностям, на которых находится вирус.

В исследовании китайских врачей были упоминания об обнаружении вируса в фекальных массах больных, однако фекально-оральный механизм передачи официально не подтверждён. [20]

Кроме того, Xia и соавт. обнаружили РНК SARS-CoV-2 в двух образцах слёз и секрета конъюнктивы у одного пациента из 30 с конъюнктивитом и с диагнозом COVID‐19. У 29 остальных пациентов конъюнктивита не было. Исследователи отметили, что передача SARS-CoV-2 через конъюнктивальный секрет не распространена и менее вероятна, но также заявили, что риск передачи не может быть полностью исключен. [21]

Вертикальная передача (от матери к ребёнку) SARS-CoV-2 не обнаружена. Однако, требуется больше исследований и доказательств, чтобы подтвердить этот вывод. [22]

Основываясь на знаниях, риск заражения SARS-CoV-2 во время процедуры трансплантации с использованием материалов, полученных из свиней, следует рассматривать как низкий, но должен быть адекватно оценен. [36] Риск, связанный с человеческой кровью для передачи другим людям, неизвестен. Имеются данные, что ни у одного реципиента тромбоцитов или эритроцитарной массы от доноров в Корее, у которых после донорства была диагностирована инфекция SARS-CoV-2 или был получен положительный результат на РНК SARS-CoV-2, не развились симптомы, связанные с COVID-19. Поэтому трансфузионная передача SARS-CoV-2 реципиентам не происходила. [37]

Клиника (как проявляется)

Инкубационный период: 14 дней (в среднем 5—6 дней).

В большинстве случаев заболевание протекает как обычная простуда, в 15% случаев – тяжелая инфекция, требующая кислородотерапии; 5% – критическая инфекция, требующая вентиляции лёгких. [23]

Азиаты мужского пола более восприимчивы к инфекции SARS-CoV-2. [5]

Клинические проявления (основанные на данных обзора, включающего данные о 1994 пациентах): повышение температуры тела (88,7%), сухой кашель (67,8%), слабость (38,1%), образование мокроты (33,4%), одышка (18,6%), боль в горле (13,9%) и головная боль (13,6%), диарея (4,8%), тошнота и рвота (3,9%) [24]. Ринорея не характерна.

У детей с COVID-19 симптомы обычно менее выражены, чем у взрослых, и проявляются в основном кашлем и лихорадкой. В настоящее время нет известных различий между клиническими проявлениями COVID-19 у беременных и небеременных женщин. [23] Повышение воспалительных маркеров и лимфоцитопения у детей наблюдалась реже. У них, казалось, был лучший прогноз, чем у взрослых. Смерти были крайне редки. [25]

Yan‐Chao Li и соавторы сделали предположение о тропности нового коронавируса к нервной ткани, так как у некоторых больных были такие симптомы, как головная боль, тошнота, рвота. Кроме того, ранее была обнаружена тропность SARS‐CoV и MERS‐CoV к нервной ткани.

Иммунокомпрометированные пациенты могут иметь атипичные проявления COVID-19. [26] Коронавирусы не вызывают более тяжелое заболевание у пациентов с иммуносупрессией. [27]

У пациентов с распространенными аллергическими заболеваниями не было выраженных симптомов и тяжелого течения. Случаи с ранее существовавшей хронической обструктивной болезнью легких или осложненной вторичной бактериальной пневмонией были более тяжелыми. [28]