Читать книгу Сборник задач и упражнений по биохимии для студентов медицинских специальностей - Дмитрий Дмитриевич Деминчук, Дмитрий Дмитриевич Грибанов, Татьяна Александровна Лобаева - Страница 8
Раздел 3. Нуклеозиды и нуклеотиды. Нуклеиновые кислоты. Матричные биосинтезы
ОглавлениеЧТО НЕОБХОДИМО ЗНАТЬ В ДАННОЙ ТЕМЕ?
Основные термины и понятия
Составные части мононуклеотида (азотистое основание, сахар пентоза, фосфат)
Нуклеозид
Нуклеотид
Нуклеиновые кислоты
Денатурация ДНК
Нуклеопротеины
ДНК
РНК
Аденин
Гуанин
Цитозин
Тимин
Урацил
Рибоза
Дезоксирибоза
Репликация
Транскрипция
Трансляция
Иметь представление о/об (знать)
О строении важнейших сложных белков (гемоглобин и миоглобин)
О характере связи между рибозой (дезоксирибозой) и азотистым основанием в нуклеозидах
О характере связи между мононуклеотидами в составе нуклеиновых кислот
Об уровнях структурной организации нуклеиновых кислот
О типах нуклеиновых кислот
Строении т-РНК, и-РНК, ДНК
О методах разделения и анализа нуклеиновых кислот
О принципах и условиях матричных биосинтезов
Уметь составлять формулы
нуклеозидов и нуклеотидов, анализировать их состав и заряд
ПЕРЕЧЕНЬ ЗАДАНИЙ ДЛЯ ВЫПОЛНЕНИЯ
ЗАДАНИЕ 1
Какой термин соответствует представленному понятию:
а) Соединение, в котором пуриновое или пиримидиновое основание связано с рибозой или дезоксирибозой – …
б) Группа органических соединений, у которых гидроксильный остаток пентозы в составе нуклеозида этерифицирован одной или несколькими фосфатными группами – …
в) Процесс, сворачивания полипептидной цепи в уникальную трехмерную пространственную структуру – …
г) Видоизмененные азотистые основания, отличающиеся по строению от аденина, гуанина, урацила и тимина – …
ЗАДАНИЕ 2
На представленных рисунках найдите структуру, соответствующую пурину и структуру, соответствующую пиримидину. Какой из этих гетероциклов является конденсированным и состоит из двух частей – пиримидина и имидазола? Подпишите составные части гетероциклов.
Назовите известные вам природные соединения производные пиримидина и пурина.
ЗАДАНИЕ 3
Известно, что чай и кофе содержат алкалоиды пуринового ряда. Проанализируйте формулы пуриновых алкалоидов. Выделите в этих формулах гетероциклическую часть.
ЗАДАНИЕ 4
В вашем распоряжении имеются формулы следующих веществ:
Используя представленные структурные компоненты, составьте химические формулы:
а) двух любых нуклеозидов
б) двух любых нуклеотидов
ЗАДАНИЕ 5
Дайте характеристику двум соединениям, формулы которых приведены ниже:
а) Название первого соединения _____________
название второго __________________________
б) Общее число нуклеотидов на рисунке__
Общее число дезоксисахаров на рисунке__названия сахаров:
Общее число моль пуриновых соединений на рисунке __, из них аденина ___
б) Суммарный заряд первого соединения___
в) Число водородных связей, образуемых первым соединением в составе ДНК___
ЗАДАНИЕ 6
Дайте характеристику двум соединениям, формулы которых приведены ниже:
а) Название первого соединения _____________
название второго __________________________
б) Число сложноэфирных связей в первом соединении__
Число моль рибозы двух соединении__
Число моль гуанина в двух соединениях __
б) Суммарный заряд первого соединения___
в) Число водородных связей, образуемых вторым соединением в составе ДНК___
ЗАДАНИЕ 7
4.1. Дайте название соединениям, формулы которых приведены ниже:______________________
Укажите, являются ли эти соединения:
□ нуклеотидом □ нуклеозидом □ азотистым основанием
Стрелками укажите на формулах N-гликозидную связь и сложноэфирную связи
Укажите на формулах атомы, которые образуют водородные связи с комплементарным азотистым основанием (обведите конкретные атомы).
ЗАДАНИЕ 8
Дайте характеристику двум соединениям, представленным выше, выбрав верные утверждения:
ЗАДАНИЕ 9
Дайте характеристику пары веществ, заполнив колонку с ответами:
ЗАДАНИЕ 10
Подпишите названия азотистых оснований, входящих в структуру:
Укажите, какое их них – пуриновое, а какое – пиримидиновое:
На рисунке выделите 3’,5’– фосфодиэфирную связь.
Может ли данное соединение быть фрагментом тРНК? Обоснуйте свой ответ.
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 11
В арсенале современных лекарственных средств используется препарат, формула которого представлена выше. Это средство зарегистрировано под торговым наименованием Кладрибин. Какие особенности структуры вы заметили у данного препарата? Предположите биологические свойства этого вещества.
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 12
В медицине используется препарат Инозин (рибоксин) как предшественник адениловых и гуаниловых нуклеотидов.
Что такое нуклеотиды? Опишите состав и биологическую роль аденозина и гуанозина в организме. Подпишите составные компоненты инозина. На основе структуры инозина объясните, почему это препарат является предшественником АТФ. Опишите предполагаемый механизм образования АТФ из инозина.
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 13
Перед вами представлена формула оротовой кислоты, калиевая соль которой используется в медицине под названием «Калия оротат». Это вещество является предшественником пиримидиновых азотистых оснований.
Как вы объясните причину использования данного препарата при ишемической болезни сердца?
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 14
Перед вами представлена формула основного компонента препарата «Изопринозин»
Это синтетическое комплексное производное пурина, обладающее иммуностимулирующей активностью и неспецифическим противовирусным действием.
Какие химические компоненты входят в состав данной структуры? Как вы объясните противовирусный эффект данного вещества?
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 15*
Аналоги нуклеозидов – это группа лекарственных средств, проявляющих активность в отношении генома вирусов, поскольку они предотвращают репликацию вируса в инфицированных клетках. Наиболее часто используется препарат Ацикловир. Как вы объясните механизм действия такого препарата основе его химической структуры? Предположите механизм действия ацикловира.
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 16
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 17
Пояснение:
ЗАДАНИЕ 18
Ниже представлены две последовательности мРНК:
5’ ЦУУЦЦУААУАГУАГАГУЦ 3’
5’ ЦУЦЦЦАААЦАГЦАГГГУА 3
а) Запишите аминокислотные последовательности, закодированные в данных фрагментах мРНК;
б) Запишите структурную формулу второй аминокислоты в структуре первого пептида.
Таблица «Генетический код»
ЗАДАНИЕ 19
Фрагмент смысловой цепи ДНК имеет следующую нуклеотидную последовательность: 5’АТТГЦЦЦАТАТГГТАТГА 3’
а) Запишите вторую цепь ДНК.
Запишите последовательность нуклеотидов мРНК, синтезируемой на данном фрагменте молекулы ДНК
б) Какая аминокислота закодирована третьим кодоном? Запишите ее структурную формулу и укажите ее классификацию по характеру бокового заместителя?
ЗАДАНИЕ 20
Фрагмент кодирующей (смысловой) цепи ДНК имеет следующую последовательность нуклеотидов: 5 ГЦАЦААТТГАГГЦЦЦАГТТААГТА 3.
а) Напишите полную аминокислотную последовательность, которая закодирована в указанном фрагменте ДНК
б) Какая аминокислота закодирована четвертым кодоном в структуре м-РНК? Запишите ее структурную формулу и дайте ее классификацию по характеру бокового заместителя?
ЗАДАНИЕ 21
Исследователь биохимической лаборатории выделил следующий фрагмент молекулы мРНК:
5 ГЦГАУУГГГЦГААААЦЦГ 3
а) Запишите аминокислотные последовательности, закодированные в данных фрагментах мРНК;
Запишите антисмысловую (транскрибируемую) и смысловую (кодирующую) цепи ДНК.
б) Какой суммарный заряд имеет этот пептид при рН 7,2, 2,3 и 12,5
Пояснение: