Читать книгу Coronavirus ( L'assassí invisible) - John Abrams - Страница 7

Mètodes d'assaig

A partir del 6 de març de 2020, que figuren els laboratoris de desenvolupament i protocols per a la detecció de virus
País	Institut	Dianes genètiques
Xina	Xina CDC	ORF1ab i nucleoproteïna (N)
Alemanya	Charité	RdRP, E, N
Hong Kong	HKU	ORF1b-nsp14, N
Japó	NIID	Pancorona i múltiples dianes,la proteïna punxa (peplomer)
Tailàndia	Institut Nacional de salut	N
Estats Units	US CDC	Tres dianes en N gen
França	Pasteur Institute	Dos objectius en el Rdrp

Detecció de virus mitjançant proves de PCR

2019-NCOV DEL CDC KIT de prova de laboratori

DEMOSTRACIÓ D'UN HISOP nasofaringi per a la prova de covid-19

DEMOSTRACIÓ D'UN HISOP de la gola per a la prova de covid-19

Utilitzant transcripció inversa en temps real de la reacció en cadena de la polimerasa (rRT-PCR) la prova es pot fer en mostres respiratòries obtingudes per diversos mètodes, incloent el Swab nasofaringi o la Mostra esput. Els resultats generalment estan disponibles en poques hores a 2 dies. La prova de RT-PCR realitzada amb hisops de gola només és fiable en la primera setmana de la malaltia. Més endavant en el virus pot desaparèixer a la gola mentre es continua multiplicar en els pulmons. Per a les persones infectades provat en la segona setmana, alternativament material de Mostra es pot prendre de les vies respiratòries profundes per catèter de succió o tos fins material (esput) es pot utilitzar.

TERCICER O TERMO TÈRMIC, també conegut com a màquina de PCR

Una de les primeres proves de PCR va ser desenvolupada a la Charité de Berlín el 2020 de gener utilitzant la reacció en cadena de la transcripció inversa en temps real (rRT-PCR), i va formar la base de 250.000 kits per a la seva distribució per l'organització mundial de la salut (OMS). El Regne Unit també havia desenvolupat una prova el 23 de gener de 2020.

L'empresa sud-coreana Kogenebiotech va desenvolupar un grau Clínic, basat en la PCR Kit de detecció SARS-COV-2 (powerchek coronavirus) el 28 de gener de 2020. ^[11]It busca el gen "E" compartit per tots els coronavirus de la beta, i el gen RDRP específic del SARS-COV-2.

A la Xina, el grup BGI va ser una de les primeres empreses a rebre l'aprovació de l'ús d'emergències de l'Administració Nacional de productes mèdics de la Xina per a un kit de detecció SARS-CoV-2 basat en PCR.

Als Estats Units, els centres per al control i la prevenció de malalties (CDC) estan distribuint el seu 2019-novel coronavirus (2019-nCoV) en temps real panell de diagnòstic RT-PCR als laboratoris de salut pública a través del recurs reactiu internacional. una de les tres proves genètiques en versions anteriors dels kits de prova va provocar resultats concloents a causa dels reactius defectuosos, i un coll d'ampolla de proves en el CDC a Atlanta; Això va resultar en una mitjana de menys de 100 mostres al dia que es va processar amb èxit durant tot el febrer de 2020. Les proves que utilitzaven dos components no estaven decidits a ser fiables fins al 28 de febrer de 2020, i no va ser fins llavors que els laboratoris locals i estatals se'ls permetia començar a provar. La prova va ser aprovada per l'administració d'aliments i medicaments sota una autorització d'ús d'emergència.

Laboratoris comercials dels EUA va començar a provar a principis de març 2020. A partir del 5 de març 2020 LabCorp va anunciar la disponibilitat a nivell nacional de les proves COVID-19 basades en RT-PCR. Quest de diagnòstic de la mateixa manera va fer la prova de COVID-19 a nivell nacional disponible a partir de 9 de març 2020.No limitacions de quantitat es van anunciar; la recollida de mostres i el processament s'han de realitzar d'acord amb els requisits del CDC.

A Rússia, la prova COVID-19 va ser desenvolupada i produïda pel centre d'investigació Estatal de Virologia i VECTOR de biotecnologia. L' 11 de febrer de 2020 la prova va ser registrada pel servei Federal de vigilància en salut.

El 12 de març de 2020, es va informar que la Clínica Mayo va desenvolupar una prova per detectar la infecció pel COVID-19.

El 13 de març de 2020, els diagnòstics de Roche van rebre l'aprovació de la FDA per a una prova que es podria realitzar dins de 3,5 hores en un volum alt, permetent així una màquina a fer aproximadament 4.128 proves en un període de 24 hores.

El 19 de març de 2020, la FDA va emetre l'autorització d'ús d'emergència (EUA) a Abbott Laboratories per a una prova sobre el sistema M2000 d'Abbott; la FDA havia emès prèviament una autorització similar a Hologic, LabCorp, i Thermo Fisher Scientific. ^[El 21 de març de 2020, cepheid va rebre igualment als EUA de la FDA per a una prova que triga uns 45 minuts.

Prova que utilitza un anticòs monoclonals que s'uneix específicament a la proteïna nucleocàpside (proteïna N) de la novel·la coronavirus està sent desenvolupada a Taiwan, amb l'esperança que pugui proporcionar resultats en 15 a 20 minuts com una prova de la grip ràpida.

Detecció de virus utilitzant proves no PCR

EL PRESIDENT DELS EUA, Donald Trump , Mostra un kit de proves covid-19 d ' Abbott Laboratories al març 2020

La FDA ha aprovat una nova prova de Abbott Labs que utilitza la tecnologia isotèrmica d'amplificació d'àcids nucleics en lloc de la PCR. Atès que això no requereix la sèrie consumint temps de cicles de temperatura altern aquest mètode pot oferir resultats positius en tan sols cinc minuts i resultats negatius en 13 minuts. Actualment hi ha prop de 18.000 d'aquestes màquines als EUA i Abbott espera rampa cap amunt de fabricació per repartir 50.000 proves per dia.

TAC de tòrax i radiografies

UNA RESSENYA DE LITERATURA de 2020 de març concloïa que "les radiografies toràciques són de poc valor diagnòstic en primeres etapes, mentre que el TC [la tomografia computada] pot estar present fins i tot abans de l'aparició dels símptomes." Les característiques típiques del TC inclouen opacitats de vidre multilobar bilaterals amb una distribució perifèrica, asimètrica i posterior. Dominància subpleural, el paviment boig i la consolidació es desenvolupen a mesura que evoluciona la malaltia. Un estudi que compara la PCR amb el CT a Wuhan en el punt d'origen de la pandèmia actual ha suggerit que la TC és significativament més sensible que la PCR, encara que menys específica, amb moltes de les seves característiques d'imatge que es superposen amb altres pneumònies i processos de malaltia. A partir de març de 2020, el col·legi americà de Radiologia recomana que "CT no s'ha d'utilitzar per a la pantalla per a o com a prova de primera línia per diagnosticar COVID-19".

Lectors humans i intel·ligència artificial

Un petit estudi va demostrar que els radiòlegs xinesos demostraven un 72 – 94% de sensibilitat i un 24 – 94% especificitat en la diferenciació del COVID-19 d'altres tipus de pneumònia viral utilitzant la imatge TC. ^[32] també s'han desenvolupat xarxes neuronals convolucionals basades en intel·ligència artificial per detectar característiques d'imatge del virus tant en radiografies com en CT amb especificitat significativament més alta.

A partir del març del 2020, el CDC recomana la PCR per a la seva detecció inicial, ja que té una major especificitat que el TC.

 

Els resultats típics de la imatge TC

 

Imatge TC de progressió ràpida.

Detecció d'anticossos

PART DE LA RESPOSTA immune a la infecció és la producció d'anticossos incloent IgM i IgG. Aquests poden ser utilitzats per detectar la infecció en individus que comencen 7 dies més o més després de l'aparició dels símptomes, per determinar la immunitat, i en la vigilància de la població.

Els assajos es poden realitzar en laboratoris centrals (CLT) o mitjançant proves puntuals d'atenció (PoCT). Els sistemes automatitzats d'alt rendiment en molts laboratoris clínics podran realitzar aquests assajos, però la seva disponibilitat dependrà de la taxa de producció de cada sistema. Per CLT un sol espècimen de sang perifèrica s'utilitza comunament, encara que els espècimens de sèrie es poden utilitzar per seguir la resposta immune. Per PoCT un sol espècimen de sang sol obtenir-se per punció cutània. A diferència dels mètodes de PCR un pas d'extracció no és necessari abans d'assaig.

El 26 de març de 2020, la FDA va nomenar 29 entitats que van proporcionar la notificació a l'agència segons sigui necessari i ara per tant són capaços de distribuir les seves proves d'anticossos. Una prova aprovada recentment per la FDA pot donar un resultat en 15 minuts. Té un 91% d'especificitat clínica i una taxa de sensibilitat clínica del 99%, segons un comunicat de premsa. Una prova altament sensible rarament domina un positiu real. Una prova molt específica poques vegades registra una classificació positiva per a qualsevol cosa que no és l'objectiu de les proves.

A finals de març de 2020, els diagnòstics de laboratori mèdics Euroimmun i Epitope diagnòstics van rebre les aprovacions europees per als seus kits de proves, que poden detectar anticossos IgG i IgA contra el virus en mostres de sang. La capacitat de prova és de diversos centenars de mostres en qüestió d'hores i, per tant, molt més ràpid que l'assaig de PCR convencional d'ARN viral. Els anticossos són generalment detectable 14 dies després de l'inici de la infecció.

Al Regne Unit

A principis d'abril, el Regne Unit no va trobar cap dels kits de prova d'anticossos que va comprar van ser prou bons per utilitzar.