Читать книгу Coronavirus Näkymätön Killer - John Abrams - Страница 7

Testausmenetelmät

WHO listasi 6 päivästä maaliskuuta 2020 virusten torjuntalaboratoriot ja -protokollat
Maa	Institute	Geenin kohteet
Kiina	Kiina CDC	ORF1ab ja nukleoproteiini (N)
Saksa	Charité	RdRP, E, N
Hongkong	Kävi koulua HKU	ORF1b-nsp14, N
Japani	Kävi koulua NIID	Pancorona ja useita tavoitteita,Spike proteiini(Peplomer)) Spike protein (
Thaimaa	Kansallinen terveysinstituutti	N
Yhdysvallat	Yhdysvaltain CDC	Kolme kohdetta N-geenissä
Ranska	Pasteur Institute	Kaksi tavoitetta rdrp:ssä

Viruksen havaitseminen PCR-testien avulla

CDC:N 2019-NCOV-LABORATORIOTESTISARJA

NENÄNIELUN OSOITTAMINEN COVID-19-testausta varten

COVID-19-TESTAUKSEN kurkun pyyhkäisynäytteen osoittaminen

Käyttämällä reaaliaikaista käänteiskopioijaentsyymin ketjureaktiota (rRT-PCR)testi voidaan tehdä hengitysnäytteistä, jotka on saatu eri menetelmillä, mukaan lukien nenänielun pyyhkäisynäyte tai yskösnäyte. Tulokset ovat yleensä saatavilla muutamassa tunnissa 2 päivää. RT-PCR-testi, joka suoritetaan kurkun pyyhkäisynäytteillä, on luotettava vain taudin ensimmäisellä viikolla. Myöhemmin virus voi kadota kurkkuun, kun se jatkaa lisääntymistä keuhkoissa. Tartunnan saaneille ihmisille testattu toisella viikolla, vaihtoehtoisesti näyte materiaali voidaan sitten ottaa syvä hengitysteihin imu katetrin tai yskiminen materiaali (yskös) voidaan käyttää.

LÄMPÖCYCLER TAI LÄMPÖ cycler, joka tunnetaan myös nimellä PCR kone

Yksi varhaisista PCR-testeistä kehitettiin Charitéssa Berliinissä tammikuussa 2020 käyttäen reaaliaikaista käänteiskopioijaentsyymin ketjureaktiota (rRT-PCR), ja se muodosti perustan 250 000 sarjalle Maailman terveysjärjestön (WHO) jakelua varten. Yhdistynyt kuningaskunta oli myös kehittänyt testin 23 päivään tammikuuta 2020 mennessä.

Etelä-Korean yritys Kogenebiotech kehitetty kliininen luokka, PCR-pohjainen SARS-CoV-2 havaitsemispakkaus (PowerChek Coronavirus) 28 tammikuu 2020. ^[11]Se etsii kaikkien beetacoronavirusten yhteistä E-geeniä ja SARS-CoV-2:lle ominaista RdRp-geeniä.

Kiinassa, BGI Group oli yksi ensimmäisistä yrityksistä saada hätäkäytön hyväksynnän Kiinan National Medical Products Administration PCR-pohjainen SARS-CoV-2 havaitseminen pakki.

Yhdysvalloissa, Centers for Disease Control and Prevention (CDC) jakaa sen 2019-Romaani Coronavirus (2019-nCoV) Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel kansanterveyden labs kautta International Reagent Resource.One kolmesta geneettinen testien vanhemmat versiot testisarjat aiheutti vakuuttavia tuloksia, koska viallinen reagensseja, ja pullonkaula testaus CDC Atlantassa; Tämä johti siihen, että keskimäärin alle 100 näytettä päivässä käsiteltiin menestyksekkäästi koko helmikuussa 2020. Kahta komponenttia käyttävien testien todettiin olevan luotettavia vasta 28 päivänä helmikuuta 2020, ja vasta sen jälkeen kyseisen valtion ja paikallisten laboratorioiden sallittiin aloittaa testaus. Testi hyväksyttiin Food and Drug Administration nojalla emergency use authorization.

Yhdysvaltain kaupalliset laboratoriot aloittivat testauksen maaliskuun alussa 2020. 5. maaliskuuta 2020 LabCorp ilmoitti valtakunnallinen saatavuus COVID-19 testaus perustuu RT-PCR. Quest Diagnostics teki myös valtakunnallisen COVID-19-testauksen saataville 9.3.2020.No määrärajoituksista ilmoitettiin; näytteiden kerääminen ja käsittely on suoritettava CDC-vaatimusten mukaisesti.

Venäjällä COVID-19-testin kehitti ja tuotti virologian ja biotekniikan vektorin valtion tutkimuskeskus. 11. helmikuuta 2020 testin rekisteröi liittovaltion valvontavirasto.

12. maaliskuuta 2020 Mayo Clinicin raportoitiin kehittäneen testin COVID-19-infektion havaitsemiseksi.

Roche Diagnostics sai 13 päivänä maaliskuuta 2020 FDA:n hyväksynnän testille, joka voitiin suorittaa 3,5 tunnin kuluessa suurena tilavuutena, jolloin yksi kone voi tehdä noin 4 128 testiä 24 tunnin aikana.

FDA antoi Abbott Laboratoriesille 19 päivänä maaliskuuta 2020 Abbott Laboratoriesille hätäkäyttöluvan Abbottin m2000-järjestelmän testaamista varten. FDA oli aiemmin antanut samanlaisen luvan Hologicille, LabCorpille ja Thermo Fisher Scientificille. ^[[21. maaliskuuta 2020, Cepheid vastaavasti sai EUA FDA: n testi, joka kestää noin 45 minuuttia.

Taiwanissa kehitetään testiä, jossa käytetään monoklonaalista vasta-ainetta, joka sitoutuu erityisesti uuden coronaviruksen nukleokapsidiproteiiniin (N-proteiiniin), ja siinä toivotaan, että se voi tuottaa tuloksia 15-20 minuutissa aivan kuten nopea influenssatesti.

Viruksen havaitseminen muilla kuin PCR-testeillä

YHDYSVALTAIN PRESIDENTTI Donald Trump näyttää COVID-19 testaus pakki Abbott Laboratories maaliskuussa 2020

FDA on hyväksynyt uuden testin Abbott Labs, joka käyttää isoterminen nukleiinihapon vahvistustekniikka sijasta PCR. Koska tämä ei edellytä aikaa vievää sarjaa vuorotellen lämpötila syklit tämä menetelmä voi tuottaa myönteisiä tuloksia niin vähän kuin viisi minuuttia ja negatiivisia tuloksia 13 minuuttia. Tällä hetkellä noin 18000 näistä koneista Yhdysvalloissa ja Abbott odottaa kiihdyttää valmistus toimittaa 50000 testiä päivässä.

Rintakehän TT- ja röntgenkuvat

MAALISKUUSSA 2020 KIRJALLISUUSKATSAUKSESSA todettiin, että "rintaröntgenkuvistoilla on vähäinen diagnostinen arvo alkuvaiheessa, kun taas CT [tietokonetomografia] löydökset voivat olla läsnä jo ennen oireiden puhkeamista." Tyypillisiä ominaisuuksia CT ovat kahdenväliset multilobar maa-lasi opacificities kanssa perifeerinen, epäsymmetrinen ja posterior jakelu. Subpleural määräävä asema, hullu päällystys ja konsolidointi kehittyvät taudin kehittyessä. Tutkimus, jossa PCR:tä verrataan CT:hen Wuhanissa nykyisen pandemian lähtöpisteessä, on ehdottanut, että CT on huomattavasti herkempi kuin PCR, vaikkakin vähemmän spesifinen, ja monet sen kuvantamisominaisuudet ovat päällekkäisiä muiden keuhkokuumeiden ja sairauksien prosessien kanssa. Maaliskuusta 2020, American College of Radiology suosittelee, että "CT ei pitäisi käyttää näytön tai ensilinjan testi diagnosoida COVID-19".

Ihmisen lukijat ja tekoäly

Pieni tutkimus osoitti, että kiinalaiset radiologit osoittivat 72–94% herkkyyttä ja 24–94% spesifisyyttä erottaa COVID- 19 muista viruskeuhkokuumeista TT-kuvantamisen avulla. ^[32] Tekoälyyn perustuvia konvolaatiohermoverkkoja on kehitetty myös viruksen kuvantamisominaisuuksien havaitsemiseksi sekä röntgenkuvissa että CT:ssä, joilla on huomattavasti suurempi spesifisyys.

CdC suosittelee maaliskuussa 2020 PCR:tä alustavaan seulontaan, koska sen spesifisyys on suurempi kuin CT:n.

 

Tyypilliset CT-kuvantamisen löydökset

 

CT kuvantaminen nopea etenemisen vaiheessa.

Vasta-aineiden osoittaminen

OSA IMMUUNIVASTETTA infektioon on vasta-aineiden, kuten IgM: n ja IgG: n, tuotanto. Näitä voidaan käyttää havaitsemaan infektio yksilöiden alkaa 7 päivää tai niin alkamisen jälkeen oireita, määrittää immuniteetti, ja väestön valvonnassa.

Määritykset voidaan suorittaa keskuslaboratorioissa (CLT) tai pistetestausta (PoCT). Suurten nopeuksien automatisoitujen järjestelmien monissa kliinisissä laboratorioissa voi suorittaa nämä määritykset, mutta niiden saatavuus riippuu tuotannon kunkin järjestelmän. CLT:lle käytetään yleisesti yhtä perifeeristä verinäytettä, vaikka sarjanäytteitä voidaan käyttää immuunivasteen seuraamiseen. PoCT:lle saadaan yleensä yksi verinäyte ihon pistoksi. Toisin pcr menetelmiä uutto vaihe ei tarvita ennen määritystä.

26. maaliskuuta 2020 FDA nimesi 29 yhteisöä, jotka toimittivat ilmoituksen virastolle tarpeen mukaan ja pystyvät nyt jakamaan vasta-ainetestinsä. Yksi testi äskettäin hyväksynyt FDA voi antaa tuloksen 15 minuuttia. Se on 91% kliininen spesifisyys määrä ja 99% kliininen herkkyys, mukaan lehdistötiedote. Erittäin herkkä testi harvoin unohdetaan todellinen positiivinen. Erittäin spesifinen testi rekisteröi harvoin positiivisen luokituksen mihinkään, mikä ei ole testauksen kohteena.

Maaliskuun lopulla 2020, Euroimmun Medical Laboratory Diagnostics ja Epitope Diagnostics sai euroopan hyväksynnät niiden testisarjat, jotka voivat havaita IgG ja IgA vasta virusta vastaan verinäytteistä. Testauskapasiteetti on useita satoja näytteitä muutamassa tunnissa ja siksi paljon nopeammin kuin perinteisen PCR määritys virus RNA. Vasta-aineet ovat yleensä havaittavissa 14 päivän kuluttua infektion puhkeamisesta.

Isossa-Britanniassa

Huhtikuun alussa Yhdistynyt kuningaskunta ei havainnut, että mikään sen ostamista vasta-ainetestisarjoista ei ollut riittävän hyvä käyttää.