Читать книгу Coronavirus (Den usynlige morder) - John Abrams - Страница 7

Prøvningsmetoder

marts 2020 opregnede WHO udviklingslaboratorier og -protokoller til påvisning af
Land	Institute	Genmål
Kina	Kina CDC	ORF1ab og Nukleoprotein (N)
Tyskland	Charité	RdRP, E, N
Hongkong	Hku	ORF1b-nsp14, N
Japan	NIID (NIID)	Pancorona og flere mål, Spike protein (Peplomer)
Thailand	Det Nationale Institut for Sundhed	N
USA	Amerikanske CDC	Tre mål i N-gen
Frankrig	Pasteur Institut	To mål i RdRP

Påvisning af virus ved hjælp af PCR-test

CDC'S 2019-NCOV LABORATORIETESTKIT

PÅVISNING AF EN NASOPHARYNGEAL podning til COVID-19-test

DEMONSTRATION AF EN halspodning til COVID-19-test

Ved hjælp af realtidsomvendt transskriptionspolymerasekædereaktion (rRT-PCR) kan testen udføres på respiratoriske prøver, der er opnået ved forskellige metoder, herunder nasopharyngeal podning eller spytprøve. Resultaterne er generelt tilgængelige inden for et par timer til 2 dage. RT-PCR-testen udført med halssvaberprøver er kun pålidelig i den første uge af sygdommen. Senere virus kan forsvinde i halsen, mens det fortsætter med at formere sig i lungerne. For smittede mennesker testet i den anden uge, alternativt prøve materiale kan derefter tages fra de dybe luftveje ved suge kateter eller hoste op materiale (spyt) kan anvendes.

EN TERMOCYCLER ELLER termisk cycler, også kendt som en PCR-maskine

En af de tidlige PCR-test blev udviklet på Charité i Berlin i januar 2020 ved hjælp af real-time reverse transskription polymerase kædereaktion (rRT-PCR), og dannede grundlag for 250.000 kits til distribution af Verdenssundhedsorganisationen (WHO). Det Forenede Kongerige havde også udviklet en test senest den 23.

Den sydkoreanske virksomhed Kogenebiotech udviklet en klinisk kvalitet, PCR-baserede SARS-CoV-2 afsløring kit (PowerChek Coronavirus) på 28 Januar 2020. ^[11]Det ser for "E" genet deles af alle beta coronaviruses, og RdRp genet er specifikke for SARS-CoV-2.

I Kina var BGI Group en af de første virksomheder, der modtog godkendelse i nødstilfælde fra Kinas National Medical Products Administration til et PCR-baseret SARS-CoV-2-detektionssæt.

I USA distribuerer Centers for Disease Control and Prevention (CDC) sin 2019-Novel Coronavirus (2019-nCoV) Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel til folkesundhedslaboratorier gennem International Reagens Resource.One af tre genetiske tests i ældre versioner af testkits forårsaget inkonklusive resultater på grund af defekte reagenser og en flaskehals af test på CDC i Atlanta; dette resulterede i, at der i gennemsnit blev behandlet færre end 100 prøver om dagen i hele februar 2020. Test med to komponenter blev først vurderet til at være pålidelige den 28. Testen blev godkendt af Food and Drug Administration under en emergency use authorization.

Amerikanske kommercielle laboratorier begyndte at teste i begyndelsen af marts 2020. marts 2020 annoncerede LabCorp landsdækkende tilgængelighed af COVID-19 test baseret på RT-PCR. Quest Diagnostics ligeledes gjort landsdækkende COVID-19 test til rådighed fra 9 Marts 2020.No mængde begrænsninger blev annonceret; indsamling og behandling af prøver skal udføres i overensstemmelse med CDC's krav.

I Rusland blev COVID-19 testen udviklet og produceret af State Research Center of Virology and Biotechnology VECTOR. den 11. februar 2020 blev testen registreret af Federal Service for Surveillance in Healthcare.

marts 2020 blev Mayo Clinic rapporteret at have udviklet en test til påvisning af COVID-19 infektion.

marts 2020 modtog Roche Diagnostics FDA-godkendelse til en test, der kunne udføres inden for 3,5 timer i høj volumen, hvilket gjorde det muligt for en maskine at udføre ca. 4.128 test inden for en 24-timers periode.

marts 2020 udstedte FDA nødbrugstilladelse (EUA) til Abbott Laboratories til en test af Abbotts m2000-system. FDA havde tidligere udstedt lignende tilladelse til Hologic, LabCorp, og Thermo Fisher Scientific. ^[marts 2020 modtog Cepheid ligeledes ERE fra FDA til en test, der tager omkring 45 minutter.

En test, der bruger et monoklonalt antistof, som specifikt binder sig til nukleocapsid protein (N protein) af romanen coronavirus er ved at blive udviklet i Taiwan, med håb om, at det kan give resultater i 15 til 20 minutter ligesom en hurtig influenzatest.

Påvisning af virus ved hjælp af ikke-PCR-test

USA'S PRÆSIDENT DONALD Trump viser en COVID-19 test kit fra Abbott Laboratories i marts 2020

FDA har godkendt en ny test af Abbott Labs, der bruger isotermisk nukleinsyre forstærkning teknologi i stedet for PCR. Da dette ikke kræver den tidskrævende serie af vekslende temperaturcyklusser, kan denne metode give positive resultater på så lidt som fem minutter og negative resultater på 13 minutter. Der er i øjeblikket omkring 18.000 af disse maskiner i USA og Abbott forventer at rampe op produktion til at levere 50.000 tests om dagen.

Ct-scanninger og røntgenbilleder af brystet

EN LITTERATURGENNEMGANG fra marts 2020 konkluderede, at "røntgenbilleder af brystet er af ringe diagnostisk værdi i de tidlige stadier, mens CT-[computertomografi] kan være til stede, selv før symptomdebut." Typiske træk ved CT omfatter bilaterale multilobar jordglas opacificities med en perifer, asymmetrisk og posterior fordeling. Subpleural dominans, skøre brolægning og konsolidering udvikle sig som sygdommen udvikler sig. En undersøgelse, der sammenligner PCR med CT i Wuhan på oprindelsesstedet for den nuværende pandemi, har antydet, at CT er betydeligt mere følsom end PCR, men mindre specifik, med mange af dens billeddannelse funktioner overlapper med andre lungebetændelser og sygdomsprocesser. Fra marts 2020 anbefaler American College of Radiology, at "CT ikke bør bruges til at screene for eller som en første-line test til at diagnosticere COVID-19".

Menneskelige læsere og kunstig intelligens

En lille undersøgelse viste, at kinesiske radiologer viste 72-94% følsomhed og 24-94% specificitet i at differentiere COVID-19 fra andre typer af viral lungebetændelse ved hjælp af CT-billeddannelse. ^[32] Kunstig intelligens baseret convolutional neurale netværk er også blevet udviklet til at opdage billeddannelse funktioner af virus både på røntgenbilleder og CT med betydeligt højere specificitet.

Pr. marts 2020 anbefaler CDC PCR til indledende screening, fordi det har højere specificitet end CT.

 

Typiske CT-billeddannelsesresultater

 

CT-billeddannelse af hurtig progressionsfase.

Påvisning af antistoffer

EN DEL AF IMMUNRESPONSET på infektion er produktion af antistoffer, herunder IgM og IgG. Disse kan bruges til at opdage infektion hos personer, der starter 7 dage eller deromkring efter symptomdebut, at bestemme immunitet, og i befolkningen overvågning.

Analyser kan udføres i centrale laboratorier (CLT) eller ved hjælp af test af plejepunkt (PoCT). De automatiserede systemer med høj gennemløb i mange kliniske laboratorier vil være i stand til at udføre disse analyser, men deres tilgængelighed vil afhænge af produktionshastigheden for hvert system. For CLT er et enkelt eksemplar af perifert blod almindeligt anvendt, selv om serielle prøver kan bruges til at følge immunresponset. For PoCT opnås et enkelt blodprøveeksemplar normalt ved hudpunktur. I modsætning til PCR metoder en udvinding trin er ikke nødvendig før analysen.

Marts 26, 2020, FDA opkaldt 29 enheder, der gav meddelelse til agenturet som krævet, og er nu i stand til at distribuere deres antistof test. En test for nylig godkendt af FDA kan give et resultat i 15 minutter. Det har en 91% klinisk specificitet sats og en 99% klinisk følsomhed sats, ifølge en pressemeddelelse. En meget følsom test overser sjældent en faktisk positiv. En meget specifik test registrerer sjældent en positiv klassificering for alt, hvad der ikke er målet for test.

I slutningen af marts 2020 modtog Euroimmun Medical Laboratory Diagnostics og Epitope Diagnostics europæiske godkendelser af deres testsæt, som kan detektere IgG- og IgA-antistoffer mod virusset i blodprøver. Testkapaciteten er flere hundrede prøver inden for få timer og derfor meget hurtigere end den konventionelle PCR-analyse af viralRNA. Antistofferne kan normalt påvises 14 dage efter infektionens indtræden.

I Storbritannien

I begyndelsen af april fandt Det Forenede Kongerige, at ingen af de antistoftestsæt, det købte, var tilstrækkeligt gode til at bruge.